![\"Capture](\"https:\/\/www.pedagogie.ac-nice.fr\/svt\/wp-content\/uploads\/sites\/5\/2019\/01\/Capture-5-1024x555.jpg\")
<\/a>Capture d’\u00e9cran d’EduAnat2 montrant une IRMf associ\u00e9e \u00e0 l’audition d’un son<\/p><\/div>\n
<\/p>\n
Fruit du travail, sur plusieurs ann\u00e9es, de l’\u00e9quipe ACCES (celle \u00e0 l’origine d’EduAnatomist), EduAnat2 repr\u00e9sente un v\u00e9ritable progr\u00e8s par rapport \u00e0 son anc\u00eatre :<\/p>\n
- \n
- l’interface a \u00e9t\u00e9 grandement simplifi\u00e9e et adapt\u00e9e \u00e0 des \u00e9l\u00e8ves de lyc\u00e9e<\/li>\n
- les axes et les plans sont annot\u00e9s<\/li>\n
- le logiciel tourne sous Windows, Linux et MacOS ; il est de plus \u00ab\u00a0portable\u00a0\u00bb (il peut s’ex\u00e9cuter sur une cl\u00e9 USB)<\/li>\n
- pour la quasi totalit\u00e9 des IRM, une reconstitution 3D de la t\u00eate ou de l’organe est propos\u00e9e<\/li>\n
- il est d\u00e9sormais possible de comparer dans une m\u00eame fen\u00eatre 2 IRM<\/li>\n<\/ul>\n
La banque d’images qui lui \u00e9tait associ\u00e9e, NeuroPeda, est elle remplac\u00e9e par une banque \u00e9largie, AnaPeda, qui contient (rassurez-vous) l’int\u00e9gralit\u00e9 des anciennes IRM\u00a0 converties au nouveau format (le format NIFTI, plus moderne). AnaPeda contient \u00e9galement de nouvelles images, notamment en lien avec les nouveaux programmes. Elle contient aussi des IRM et des CT-Scans sans rapport avec les neurosciences, comme par exemple des IRM de souris et de grenouille (pour \u00e9tudier les plans d’organisation), un scan thorax+abdomen humain et m\u00eame une pelote de r\u00e9jection.<\/p>\n
![\"\"](\"https:\/\/www.pedagogie.ac-nice.fr\/svt\/wp-content\/uploads\/sites\/5\/2019\/01\/Capture-6-1024x555.jpg\")
<\/a>Comparaison dans une m\u00eame fen\u00eatre d’une IRM de souris et d’un Scan thoracique humain<\/p><\/div>\n
Remarque importante : EduAnat2 n’ouvrira pas les fichiers au format ANALYZE (ceux d’Edu’anatomist), il est donc imp\u00e9ratif de t\u00e9l\u00e9charger cette banque.<\/p>\n
De plus, attirons l’attention sur la syntaxe particuli\u00e8re des noms de fichier de cette banque.<\/p>\n
En g\u00e9n\u00e9ral, un sujet d’exp\u00e9rience est associ\u00e9 au moins \u00e0 3 fichiers :<\/p>\n
- \n
- un fichier dont le nom se termine par .anat.nii.gz et qui correspond \u00e0 l’IRM anatomique<\/li>\n
- un fichier dont le nom se termine par .fonc.nii.gz et qui correspond au calque fonctionnel<\/li>\n
- un fichier dont le nom se termine par .stl et qui correspond au mod\u00e8le 3D<\/li>\n<\/ul>\n
Il est bien entendu possible de renommer ce fichier, \u00e0 condition d’une part de conserver ces extensions, et d’autre part de faire attention \u00e0 ce que le nom de fichier de l’IRM anatomique soit le m\u00eame que celui du mod\u00e8le (\u00e0 part pour l’extension bien entendu).<\/p>\n
Par exemple :
\nIRMchien.anat.nii.gz
\net
\nIRMchien.stl<\/p>\n(contrairement \u00e0 Edu’anatomist, EduAnat2 supporte les accents dans le nom des dossiers)<\/p>\n
Enfin, signalons que les valeurs de seuil de chaque image sont disponibles sur le site ACCES (voir liens plus bas), pour ceux qui pr\u00e9f\u00e8rent les donner aux \u00e9l\u00e8ves. Ces valeurs correspondent aux seuils utilis\u00e9s dans les publications scientifiques dont sont issues les images.<\/p>\n
<\/p>\n
Liens :<\/p>\n
- \n
- pr\u00e9sentation d’EduAnat2 sur le site ACCES<\/a><\/li>\n
- tableau de correspondance entre l’ancienne et la nouvelle banque<\/a><\/li>\n
- valeurs de seuil<\/a><\/li>\n
- t\u00e9l\u00e9chargement de la banque AnaPeda<\/a><\/li>\n
- fiche technique pour une IRM anatomique<\/a><\/li>\n
- fiche technique pour une IRM fonctionnelle<\/a><\/li>\n<\/ul>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"
Apr\u00e8s des ann\u00e9es de bons et loyaux services, Edu’anatomist, le logiciel utilis\u00e9 pour visualiser des IRM en classe, tire sa r\u00e9v\u00e9rence pour laisser la place \u00e0 EduAnat2, son successeur.<\/p>
Lire la suite<\/a><\/p>\n","protected":false},"author":74,"featured_media":1065,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"ngg_post_thumbnail":0,"footnotes":""},"categories":[18,8,57],"tags":[170,136,137,44,138],"class_list":["post-1063","post","type-post","status-publish","format-standard","has-post-thumbnail","hentry","category-devant-ecran","category-logiciels","category-veille-technologique","tag-170","tag-eduanatomist","tag-eduanat2","tag-irm","tag-neurosciences","nodate","item-wrap"],"rttpg_featured_image_url":{"full":["https:\/\/www.pedagogie.ac-nice.fr\/svt\/wp-content\/uploads\/sites\/5\/2019\/01\/Capture-6.jpg",1920,1041,false],"landscape":["https:\/\/www.pedagogie.ac-nice.fr\/svt\/wp-content\/uploads\/sites\/5\/2019\/01\/Capture-6.jpg",1920,1041,false],"portraits":["https:\/\/www.pedagogie.ac-nice.fr\/svt\/wp-content\/uploads\/sites\/5\/2019\/01\/Capture-6.jpg",1920,1041,false],"thumbnail":["https:\/\/www.pedagogie.ac-nice.fr\/svt\/wp-content\/uploads\/sites\/5\/2019\/01\/Capture-6-150x150.jpg",150,150,true],"medium":["https:\/\/www.pedagogie.ac-nice.fr\/svt\/wp-content\/uploads\/sites\/5\/2019\/01\/Capture-6-300x163.jpg",300,163,true],"large":["https:\/\/www.pedagogie.ac-nice.fr\/svt\/wp-content\/uploads\/sites\/5\/2019\/01\/Capture-6-1024x555.jpg",436,236,true],"1536x1536":["https:\/\/www.pedagogie.ac-nice.fr\/svt\/wp-content\/uploads\/sites\/5\/2019\/01\/Capture-6.jpg",1536,833,false],"2048x2048":["https:\/\/www.pedagogie.ac-nice.fr\/svt\/wp-content\/uploads\/sites\/5\/2019\/01\/Capture-6.jpg",1920,1041,false],"graphene_slider":["https:\/\/www.pedagogie.ac-nice.fr\/svt\/wp-content\/uploads\/sites\/5\/2019\/01\/Capture-6.jpg",182,99,false],"graphene_featured_image":["https:\/\/www.pedagogie.ac-nice.fr\/svt\/wp-content\/uploads\/sites\/5\/2019\/01\/Capture-6.jpg",436,236,false],"post-thumbnail":["https:\/\/www.pedagogie.ac-nice.fr\/svt\/wp-content\/uploads\/sites\/5\/2019\/01\/Capture-6-1000x288.jpg",694,200,true],"advps-thumb-one":["https:\/\/www.pedagogie.ac-nice.fr\/svt\/wp-content\/uploads\/sites\/5\/2019\/01\/Capture-6.jpg",406,220,false]},"rttpg_author":{"display_name":"Philippe COSENTINO","author_link":"https:\/\/www.pedagogie.ac-nice.fr\/svt\/?author=74"},"rttpg_comment":0,"rttpg_category":"Devant l'\u00e9cran<\/a> Logiciels<\/a> Veille technologique<\/a>","rttpg_excerpt":"Apr\u00e8s des ann\u00e9es de bons et loyaux services, Edu’anatomist, le logiciel utilis\u00e9 pour visualiser des IRM en classe, tire sa r\u00e9v\u00e9rence pour laisser la place \u00e0 EduAnat2, son successeur.","post_mailing_queue_ids":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.pedagogie.ac-nice.fr\/svt\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/1063","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.pedagogie.ac-nice.fr\/svt\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.pedagogie.ac-nice.fr\/svt\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.pedagogie.ac-nice.fr\/svt\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/users\/74"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.pedagogie.ac-nice.fr\/svt\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fcomments&post=1063"}],"version-history":[{"count":2,"href":"https:\/\/www.pedagogie.ac-nice.fr\/svt\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/1063\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":1349,"href":"https:\/\/www.pedagogie.ac-nice.fr\/svt\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/1063\/revisions\/1349"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.pedagogie.ac-nice.fr\/svt\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/media\/1065"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.pedagogie.ac-nice.fr\/svt\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fmedia&parent=1063"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.pedagogie.ac-nice.fr\/svt\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fcategories&post=1063"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.pedagogie.ac-nice.fr\/svt\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Ftags&post=1063"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}
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