{"id":2925,"date":"2021-01-04T22:09:49","date_gmt":"2021-01-04T21:09:49","guid":{"rendered":"https:\/\/www.pedagogie.ac-nice.fr\/svt\/?p=2925"},"modified":"2021-01-04T22:40:15","modified_gmt":"2021-01-04T21:40:15","slug":"geniegen2-creer-un-lien-direct-vers-des-sequences-a-destination-des-eleves","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.pedagogie.ac-nice.fr\/svt\/?p=2925","title":{"rendered":"Geniegen2 : cr\u00e9er un lien direct vers des s\u00e9quences \u00e0 destination des \u00e9l\u00e8ves"},"content":{"rendered":"

par Philippe Cosentino<\/em><\/p>\n

Geniegen2 est un logiciel en ligne et hors ligne qui permet de faire travailler les \u00e9l\u00e8ves sur des s\u00e9quences polypeptidiques ou nucl\u00e9otidiques, que ce soit en classe ou \u00e0 leur domicile.<\/p>\n

Dans ce dernier cas (travail distanciel), l’une des difficult\u00e9s rencontr\u00e9es par les enseignants est la mise \u00e0 disposition des s\u00e9quences.<\/p>\n

Des solutions existent heureusement, qui \u00e9viteront de passer par des fichiers (fichiers de s\u00e9quences anag\u00e8ne .edi par exemple) qui seraient tr\u00e8s durs \u00e0 g\u00e9rer pour un \u00e9l\u00e8ve travaillant sur une tablette.<\/p>\n

1er cas : les s\u00e9quences sont dans la banque de Geniegen2<\/h2>\n

Il s’agit du cas le plus simple \u00e0 r\u00e9soudre.<\/p>\n

Si l’enseignant le souhaite, l’\u00e9l\u00e8ve peut chercher par lui-m\u00eame les s\u00e9quences \u00e0 l’aide de mots cl\u00e9s, cliquer sur les s\u00e9quences qu’il souhaite comparer et enfin sur \u00ab\u00a0Charger ces s\u00e9quences\u00a0\u00bb.<\/p>\n

Mais l’enseignant peut \u00e9galement cr\u00e9er un lien direct vers une ou plusieurs s\u00e9quences de la banque. La proc\u00e9dure est alors la suivante.<\/p>\n

Tout d’abord l’enseignant s\u00e9lectionne les s\u00e9quences qui l’int\u00e9ressent comme l’\u00e9l\u00e8ve le ferait.<\/p>\n

\"\"<\/a>

Capture d’\u00e9cran de Geniegen2, montrant comment les s\u00e9quences s\u00e9lectionn\u00e9es apparaissent.<\/p><\/div>\n

Puis, au lieu de cliquer sur \u00ab\u00a0Charger ces s\u00e9quences\u00a0\u00bb, il clique sur \u00ab\u00a0Partager via un lien\u00a0\u00bb.<\/p>\n

Geniegen2 fournit alors \u00e0 l’enseignant une URL, qu’il peut copier, ou ouvrir, afin de la distribuer aux \u00e9l\u00e8ves (via son ENT, Pronote, Pearltrees etc.).<\/p>\n

\"\"<\/a><\/p>\n

Lorsque l’\u00e9l\u00e8ve clique sur ce lien, Geniegen2 s’ouvrira directement avec les s\u00e9quences \u00e0 l’\u00e9cran.<\/p>\n

\"\"<\/a>

Voici \u00e0 quoi ressemble l’\u00e9cran de l’\u00e9l\u00e8ve lorsqu’il a cliqu\u00e9 sur le lien direct.<\/p><\/div>\n

 <\/p>\n

2\u00e8me cas : les s\u00e9quences sont rassembl\u00e9es dans un fichier .edi d\u00e9tenu par l’enseignant<\/h2>\n

Dans certains cas l’enseignant souhaite faire travailler les \u00e9l\u00e8ves sur des s\u00e9quences qu’il a lui m\u00eame r\u00e9cup\u00e9r\u00e9es ou renomm\u00e9es. Ces s\u00e9quences sont g\u00e9n\u00e9ralement rassembl\u00e9es dans un fichier au format anag\u00e8ne, c’est \u00e0 dire un fichier d’extension .edi.<\/p>\n

Dans ce cas il est \u00e9galement possible de fournir un lien direct aux \u00e9l\u00e8ves, m\u00eame si la solution est un peu plus complexe.<\/p>\n

Tout d’abord il faut h\u00e9berger le fichier .edi sur internet, mais il faut \u00e9galement que l’h\u00e9bergeur accepte les requ\u00eates provenant d’un autre site (CORS = Cross-origin resource sharing).<\/p>\n

C’est le cas de Dropbox, ou de Github par exemple.<\/p>\n

Nous d\u00e9velopperons la solution utilisant Dropbox.<\/p>\n

Attention : la solution pr\u00e9sent\u00e9e ici ne met pas en danger les donn\u00e9es personnelles de l’\u00e9l\u00e8ve car il ne se connecte pas directement au service Dropbox. Cependant il convient de rappeler que ces outils h\u00e9bergent les donn\u00e9es sur des serveurs situ\u00e9s \u00e0 l’\u00e9tranger (RGPD).<\/p>\n

Une fois la s\u00e9quence d\u00e9pos\u00e9e dans un dossier Dropbox, l’enseignant r\u00e9cup\u00e8re le lien de partage de ce fichier.<\/p>\n

\"\"<\/a><\/p>\n

Cette adresse cependant ne permet pas de partager directement la s\u00e9quence (si on la saisit dans le navigateur, ce n’est pas la s\u00e9quence que l’on voit \u00e0 l’\u00e9cran mais une fen\u00eatre de dialogue invitant \u00e0 t\u00e9l\u00e9charger le fichier).<\/p>\n

Il faudra donc remplacer le d\u00e9but de l’adresse par<\/p>\n

https:\/\/dl.dropboxusercontent.com\/<\/p>\n

Au final, en combinant les 2, l’URL de la s\u00e9quence (dans l’exemple suivant) ressemblera \u00e0 ceci :<\/p>\n

https:\/\/dl.dropboxusercontent.com\/s\/vn4o1tj31qj59zt\/tyrcod.edi<\/p>\n

Pour v\u00e9rifier qu’on ne s’est pas tromp\u00e9, on peut saisir l’URL dans un navigateur et v\u00e9rifier que la s\u00e9quence appara\u00eet \u00e0 l’\u00e9cran.<\/p>\n

\"\"<\/a><\/p>\n

Enfin, pour cr\u00e9er le lien direct, on rajoute cette adresse \u00e0 la suite de celle de Geniegen2, gr\u00e2ce \u00e0 l’argument ?url=<\/p>\n

Cela donne :<\/p>\n

https:\/\/www.pedagogie.ac-nice.fr\/svt\/productions\/geniegen2\/?url=https:\/\/dl.dropboxusercontent.com\/s\/vn4o1tj31qj59zt\/tyrcod.edi<\/a><\/p>\n

En cliquant sur ce lien, \u00e0 partir de son ordinateur ou de sa tablette, l’\u00e9l\u00e8ve ouvrira directement la s\u00e9quence dans Geniegen2.<\/p>\n

Cette manipulation peut sembler laborieuse, cela est vrai uniquement pour la premi\u00e8re fois, vu que par la suite la proc\u00e9dure est toujours la m\u00eame.<\/p>\n

Au final elle permet de faciliter l’acc\u00e8s de la s\u00e9quence \u00e0 l’\u00e9l\u00e8ve, mais \u00e9galement une int\u00e9gration directe des s\u00e9quences \u00e0 \u00e9tudier dans le cours (Moodle) ou dans un produit multim\u00e9dia (Genially par exemple).<\/p>\n

 <\/p>\n

Liens<\/h2>\n

Article d\u00e9crivant Geniegen2<\/a><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

par Philippe Cosentino Geniegen2 est un logiciel en ligne et hors ligne qui permet de faire travailler les \u00e9l\u00e8ves sur des s\u00e9quences polypeptidiques ou nucl\u00e9otidiques, que ce soit en classe ou \u00e0 leur domicile. Dans ce dernier cas (travail distanciel), l’une des difficult\u00e9s rencontr\u00e9es par les enseignants est la mise \u00e0 disposition des s\u00e9quences. Des … <\/p>\n

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