{"id":3228,"date":"2021-05-29T14:12:57","date_gmt":"2021-05-29T12:12:57","guid":{"rendered":"https:\/\/www.pedagogie.ac-nice.fr\/svt\/?p=3228"},"modified":"2024-01-15T16:47:46","modified_gmt":"2024-01-15T15:47:46","slug":"eduanat2-et-ponderations-pourquoi-les-couleurs-semblent-inversees-sur-certaines-irm","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.pedagogie.ac-nice.fr\/svt\/?p=3228","title":{"rendered":"EduAnat2 et pond\u00e9rations : pourquoi les couleurs semblent invers\u00e9es sur certaines IRM ?"},"content":{"rendered":"<p style=\"text-align: right;\"><em>par Philippe Cosentino<\/em><\/p>\n<p>La question revient souvent : \u00ab\u00a0Pourquoi sur certaines IRM anatomiques, la substance blanche c\u00e9r\u00e9brale appara\u00eet plus sombre que le cortex, alors que sur d&rsquo;autres c&rsquo;est l&rsquo;inverse ?\u00a0\u00bb.<!--more--><\/p>\n<div id=\"attachment_3230\" style=\"width: 449px\" class=\"wp-caption alignnone\"><a href=\"https:\/\/www.pedagogie.ac-nice.fr\/svt\/?attachment_id=3230\" rel=\"attachment wp-att-3230\"><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" aria-describedby=\"caption-attachment-3230\" class=\"wp-image-3230\" src=\"https:\/\/www.pedagogie.ac-nice.fr\/svt\/wp-content\/uploads\/sites\/5\/2021\/05\/Capture-300x184.jpg\" alt=\"\" width=\"449\" height=\"276\" srcset=\"https:\/\/www.pedagogie.ac-nice.fr\/svt\/wp-content\/uploads\/sites\/5\/2021\/05\/Capture-300x184.jpg 300w, https:\/\/www.pedagogie.ac-nice.fr\/svt\/wp-content\/uploads\/sites\/5\/2021\/05\/Capture-768x472.jpg 768w, https:\/\/www.pedagogie.ac-nice.fr\/svt\/wp-content\/uploads\/sites\/5\/2021\/05\/Capture-436x268.jpg 436w, https:\/\/www.pedagogie.ac-nice.fr\/svt\/wp-content\/uploads\/sites\/5\/2021\/05\/Capture.jpg 793w\" sizes=\"auto, (max-width: 449px) 100vw, 449px\" \/><\/a><p id=\"caption-attachment-3230\" class=\"wp-caption-text\">Sur cette capture d&rsquo;\u00e9cran (sujet 12211), le cortex appara\u00eet bien plus clair que la substance blanche.<\/p><\/div>\n<p>Comme nous allons le voir, ce qui ressemble \u00e0 une \u00ab\u00a0inversion\u00a0\u00bb des niveaux de gris entre ces deux tissus ne rel\u00e8ve pas d&rsquo;une erreur mais d&rsquo;un choix d\u00e9lib\u00e9r\u00e9.<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<h2>Un exemple pour comprendre<\/h2>\n<p>Prenons par exemple le sujet 12222 qui souffre d&rsquo;une tumeur dans le lobe temporal (pr\u00e8s de l&rsquo;aire auditive).<\/p>\n<p>Pour commencer, lorsque l&rsquo;on explore le dossier contenant son imagerie, on remarque que deux IRM anatomiques sont disponibles. Au nom de fichier de la premi\u00e8re est accol\u00e9 \u00ab\u00a0T1\u00a0\u00bb alors qu&rsquo;\u00e0 l&rsquo;autre est accol\u00e9 \u00ab\u00a0T2\u00a0\u00bb.<\/p>\n<p><a href=\"https:\/\/www.pedagogie.ac-nice.fr\/svt\/?attachment_id=3231\" rel=\"attachment wp-att-3231\"><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" class=\"alignnone size-medium wp-image-3231\" src=\"https:\/\/www.pedagogie.ac-nice.fr\/svt\/wp-content\/uploads\/sites\/5\/2021\/05\/Capture2-300x43.jpg\" alt=\"\" width=\"300\" height=\"43\" srcset=\"https:\/\/www.pedagogie.ac-nice.fr\/svt\/wp-content\/uploads\/sites\/5\/2021\/05\/Capture2-300x43.jpg 300w, https:\/\/www.pedagogie.ac-nice.fr\/svt\/wp-content\/uploads\/sites\/5\/2021\/05\/Capture2-436x62.jpg 436w, https:\/\/www.pedagogie.ac-nice.fr\/svt\/wp-content\/uploads\/sites\/5\/2021\/05\/Capture2.jpg 688w\" sizes=\"auto, (max-width: 300px) 100vw, 300px\" \/><\/a><\/p>\n<p>Si nous ouvrons et comparons ces 2 images que constatons-nous.<\/p>\n<p><a href=\"https:\/\/www.pedagogie.ac-nice.fr\/svt\/?attachment_id=3232\" rel=\"attachment wp-att-3232\"><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" class=\"alignnone wp-image-3232\" src=\"https:\/\/www.pedagogie.ac-nice.fr\/svt\/wp-content\/uploads\/sites\/5\/2021\/05\/Capture3-1-1024x416.jpg\" alt=\"\" width=\"640\" height=\"260\" srcset=\"https:\/\/www.pedagogie.ac-nice.fr\/svt\/wp-content\/uploads\/sites\/5\/2021\/05\/Capture3-1-1024x416.jpg 1024w, https:\/\/www.pedagogie.ac-nice.fr\/svt\/wp-content\/uploads\/sites\/5\/2021\/05\/Capture3-1-300x122.jpg 300w, https:\/\/www.pedagogie.ac-nice.fr\/svt\/wp-content\/uploads\/sites\/5\/2021\/05\/Capture3-1-768x312.jpg 768w, https:\/\/www.pedagogie.ac-nice.fr\/svt\/wp-content\/uploads\/sites\/5\/2021\/05\/Capture3-1-1536x624.jpg 1536w, https:\/\/www.pedagogie.ac-nice.fr\/svt\/wp-content\/uploads\/sites\/5\/2021\/05\/Capture3-1-436x177.jpg 436w, https:\/\/www.pedagogie.ac-nice.fr\/svt\/wp-content\/uploads\/sites\/5\/2021\/05\/Capture3-1.jpg 1919w\" sizes=\"auto, (max-width: 640px) 100vw, 640px\" \/><\/a><\/p>\n<p>Sur l&rsquo;image de gauche (T1) la substance blanche appara\u00eet plus claire que le cortex, alors que sur l&rsquo;image de droite (T2) c&rsquo;est le contraire.<\/p>\n<p>On retrouve cela dans d&rsquo;autres lots d&rsquo;images, dans la banque AnaPeda, et \u00e0 chaque fois les images not\u00e9es T2 pr\u00e9sentent une substance blanche sombre.<\/p>\n<p>Il s&rsquo;agit donc de comprendre \u00e0 quoi correspondent ces T1 et T2 qui semblent d\u00e9terminants.<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<h2>Pond\u00e9rations T1 et T2 : point th\u00e9orique<\/h2>\n<p>Avant d&rsquo;expliquer \u00e0 quoi correspondent ces temps T1 et T2, il est n\u00e9cessaire de faire un petit r\u00e9capitulatif th\u00e9orique.<\/p>\n<p>L&rsquo;IRM anatomique, qui repose sur la r\u00e9sonnance magn\u00e9tique nucl\u00e9aire, a un fonctionnement dont le principe peut se r\u00e9sumer ainsi :<\/p>\n<p><a href=\"https:\/\/www.pedagogie.ac-nice.fr\/svt\/?attachment_id=3235\" rel=\"attachment wp-att-3235\"><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" class=\"alignnone wp-image-3235 size-full\" src=\"https:\/\/www.pedagogie.ac-nice.fr\/svt\/wp-content\/uploads\/sites\/5\/2021\/05\/Image1.jpg\" alt=\"\" width=\"597\" height=\"343\" srcset=\"https:\/\/www.pedagogie.ac-nice.fr\/svt\/wp-content\/uploads\/sites\/5\/2021\/05\/Image1.jpg 597w, https:\/\/www.pedagogie.ac-nice.fr\/svt\/wp-content\/uploads\/sites\/5\/2021\/05\/Image1-300x172.jpg 300w, https:\/\/www.pedagogie.ac-nice.fr\/svt\/wp-content\/uploads\/sites\/5\/2021\/05\/Image1-436x250.jpg 436w\" sizes=\"auto, (max-width: 597px) 100vw, 597px\" \/><\/a><\/p>\n<ul>\n<li>on place l&rsquo;individu dans un champ magn\u00e9tique statique (1) tr\u00e8s puissant, ce qui va imposer une orientation au spin des protons pr\u00e9sents dans les mol\u00e9cules d&rsquo;eau de ses tissus<\/li>\n<li>on envoie ensuite des impulsions \u00e9lectromagn\u00e9tiques (2) qui vont \u00ab\u00a0d\u00e9stabiliser\u00a0\u00bb les protons, certains d&rsquo;entre eux vont alors basculer comme des quilles et ne plus \u00eatre align\u00e9s avec le champ statique<\/li>\n<li>peu de temps apr\u00e8s (de l&rsquo;ordre de la seconde) cette impulsion les protons vont \u00e0 nouveau aligner leur spin avec le champ statique (on parle de \u00ab\u00a0relaxation\u00a0\u00bb)<\/li>\n<li>cette relaxation entra\u00eene l&rsquo;\u00e9mission d&rsquo;un photon (3), qui va \u00eatre capt\u00e9 par l&rsquo;antenne de l&rsquo;IRM. Ce sont ces photons, \u00e9mis par les protons lors de la relaxation, et capt\u00e9s par l&rsquo;antenne de l&rsquo;appareil, qui permettent de construire l&rsquo;image.<\/li>\n<\/ul>\n<p>Or, il existe deux aspects \u00e0 cette relaxation, une composante longitudinale et une composante transversale, ces deux relaxations n&rsquo;ayant pas lieu en m\u00eame temps : les termes T1 et T2 font r\u00e9f\u00e9rence \u00e0 ces deux temps de relaxation (T1 : relaxation longitudinale, T2 : relaxation transversale).<\/p>\n<p>Si l&rsquo;on r\u00e8gle le temps d&rsquo;\u00e9cho (le temps qui s\u00e9pare le moment on envoie l&rsquo;impulsion et le moment o\u00f9 on enregistre avec l&rsquo;antenne) en le calant plut\u00f4t sur T1 ou T2, on obtiendra un signal qui correspondra plut\u00f4t \u00e0 la relaxation longitudinale ou transversale.<\/p>\n<p>On parle alors de \u00ab\u00a0pond\u00e9ration T1\u00a0\u00bb ou de \u00ab\u00a0pond\u00e9ration T2\u00a0\u00bb (on peut \u00e9galement r\u00e9gler l&rsquo;appareil pour que le signal corresponde \u00e0 la densit\u00e9 protonique, on parle de \u00ab\u00a0pond\u00e9ration rh\u00f4\u00a0\u00bb).<\/p>\n<p>Nous venons donc de voir que T1 et T2 faisaient r\u00e9f\u00e9rence aux temps de relaxation, sur lesquels on va r\u00e9gler les temps d&rsquo;\u00e9cho de la machine, c&rsquo;est \u00e0 dire le d\u00e9lai s\u00e9parant l&rsquo;impulsion radiofr\u00e9quence et le moment o\u00f9 l&rsquo;on enregistre le signal avec l&rsquo;antenne.<\/p>\n<p>Nous allons \u00e0 pr\u00e9sent voir quel est l&rsquo;impact de ce choix sur le type d&rsquo;image obtenu.<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<h2>Impact de la nature des tissus sur le signal capt\u00e9<\/h2>\n<p>Pour faire simple, le temps de relaxation d&rsquo;un proton ne sera pas le m\u00eame selon qu&rsquo;on se trouve dans un tissu riche en eau ou en lipides.<\/p>\n<p>Ainsi ces temps seront beaucoup plus longs dans le liquide c\u00e9phalo-rachidien, aqueux (de l&rsquo;ordre de 1 \u00e0 2 secondes) que dans la substance blanche, lipidique (quelques dizaines ou centaines de millisecondes).<\/p>\n<p>Lorsque l&rsquo;on opte pour une pond\u00e9ration T1, les tissus riches en lipides appara\u00eetront ainsi tr\u00e8s clairs, alors que les tissus riches en eau appara\u00eetront fonc\u00e9s.<\/p>\n<p>Ce sera le contraire avec une pond\u00e9ration T2.<\/p>\n<div id=\"attachment_3238\" style=\"width: 639px\" class=\"wp-caption alignnone\"><a href=\"https:\/\/www.pedagogie.ac-nice.fr\/svt\/?attachment_id=3238\" rel=\"attachment wp-att-3238\"><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" aria-describedby=\"caption-attachment-3238\" class=\"wp-image-3238\" src=\"https:\/\/www.pedagogie.ac-nice.fr\/svt\/wp-content\/uploads\/sites\/5\/2021\/05\/Image3-1024x572.jpg\" alt=\"\" width=\"639\" height=\"357\" srcset=\"https:\/\/www.pedagogie.ac-nice.fr\/svt\/wp-content\/uploads\/sites\/5\/2021\/05\/Image3-1024x572.jpg 1024w, https:\/\/www.pedagogie.ac-nice.fr\/svt\/wp-content\/uploads\/sites\/5\/2021\/05\/Image3-300x168.jpg 300w, https:\/\/www.pedagogie.ac-nice.fr\/svt\/wp-content\/uploads\/sites\/5\/2021\/05\/Image3-768x429.jpg 768w, https:\/\/www.pedagogie.ac-nice.fr\/svt\/wp-content\/uploads\/sites\/5\/2021\/05\/Image3-436x243.jpg 436w, https:\/\/www.pedagogie.ac-nice.fr\/svt\/wp-content\/uploads\/sites\/5\/2021\/05\/Image3.jpg 1062w\" sizes=\"auto, (max-width: 639px) 100vw, 639px\" \/><\/a><p id=\"caption-attachment-3238\" class=\"wp-caption-text\">Images IRM obtenues avec diff\u00e9rentes substances.<\/p><\/div>\n<p>Ceci explique pourquoi la substance blanche, tr\u00e8s riche en lipides (car constitu\u00e9e en grande partie de fibres et donc de membrane) appara\u00eet claire en T1 et fonc\u00e9e en T2.<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<h2>Int\u00e9r\u00eat de disposer de pond\u00e9rations diff\u00e9rentes<\/h2>\n<p>Il existe donc dans la banque AnaPeda des IRM obtenues en pond\u00e9ration T1 et d&rsquo;autres en pond\u00e9ration T2. Souvent les deux types de pond\u00e9ration sont disponible dans un dossier.<\/p>\n<p>On pourrait \u00eatre tent\u00e9 de n&rsquo;utiliser que les pond\u00e9rations T1, car elles correspondent davantage \u00e0 l&rsquo;id\u00e9e que l&rsquo;on se fait des \u00ab\u00a0teintes\u00a0\u00bb de ces tissus (substance blanche plus claire). Mais gardons en t\u00eate, et rappelons-le \u00e0 nos \u00e9l\u00e8ves, que ces teintes n&rsquo;ont rien \u00e0 voir avec ce que la lumi\u00e8re visible nous renvoie lorsque l&rsquo;on diss\u00e8que un cerveau. Aucun parall\u00e8le ne doit \u00eatre fait entre les niveaux de gris observ\u00e9s \u00e0 l&rsquo;IRM et la teinte r\u00e9elle des tissus, au contraire il faut insister sur le fait que l&rsquo;image que l&rsquo;\u00e9l\u00e8ve a \u00e0 l&rsquo;\u00e9cran n&rsquo;est qu&rsquo;une repr\u00e9sentation, reconstruite par l&rsquo;ordinateur \u00e0 partir des donn\u00e9es collect\u00e9es par l&rsquo;antenne de l&rsquo;appareil, et non une \u00ab\u00a0photographie\u00a0\u00bb.<\/p>\n<p>La pond\u00e9ration T2, si elle aboutit \u00e0 des images qui peuvent \u00ab\u00a0surprendre\u00a0\u00bb par leur contraste \u00ab\u00a0invers\u00e9\u00a0\u00bb, a l&rsquo;avantage de montrer avec un contraste plus important les l\u00e9sions des tissus c\u00e9r\u00e9braux, que ce soit un AVC ou une tumeur. Cette pond\u00e9ration est ainsi souvent utilis\u00e9e en m\u00e9decine, pour les d\u00e9tecter.<\/p>\n<div id=\"attachment_3240\" style=\"width: 639px\" class=\"wp-caption alignnone\"><a href=\"https:\/\/www.pedagogie.ac-nice.fr\/svt\/?attachment_id=3240\" rel=\"attachment wp-att-3240\"><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" aria-describedby=\"caption-attachment-3240\" class=\"wp-image-3240\" src=\"https:\/\/www.pedagogie.ac-nice.fr\/svt\/wp-content\/uploads\/sites\/5\/2021\/05\/Capture5-1024x413.jpg\" alt=\"\" width=\"639\" height=\"258\" srcset=\"https:\/\/www.pedagogie.ac-nice.fr\/svt\/wp-content\/uploads\/sites\/5\/2021\/05\/Capture5-1024x413.jpg 1024w, https:\/\/www.pedagogie.ac-nice.fr\/svt\/wp-content\/uploads\/sites\/5\/2021\/05\/Capture5-300x121.jpg 300w, https:\/\/www.pedagogie.ac-nice.fr\/svt\/wp-content\/uploads\/sites\/5\/2021\/05\/Capture5-768x310.jpg 768w, https:\/\/www.pedagogie.ac-nice.fr\/svt\/wp-content\/uploads\/sites\/5\/2021\/05\/Capture5-1536x620.jpg 1536w, https:\/\/www.pedagogie.ac-nice.fr\/svt\/wp-content\/uploads\/sites\/5\/2021\/05\/Capture5-436x176.jpg 436w, https:\/\/www.pedagogie.ac-nice.fr\/svt\/wp-content\/uploads\/sites\/5\/2021\/05\/Capture5.jpg 1920w\" sizes=\"auto, (max-width: 639px) 100vw, 639px\" \/><\/a><p id=\"caption-attachment-3240\" class=\"wp-caption-text\">Le sujet 12223 est atteint d&rsquo;une tumeur \u00e0 l&rsquo;origine d&rsquo;un d\u00e9ficit moteur. Cette tumeur appara\u00eet bien plus nettement en T2 (\u00e0 droite) qu&rsquo;en T1 (\u00e0 gauche).<\/p><\/div>\n<p>Enfin, discuter avec les \u00e9l\u00e8ves de ces deux types d&rsquo;images permet d&rsquo;aiguiser leur esprit critique, ainsi que la posture qu&rsquo;ils peuvent avoir face aux \u00ab\u00a0images\u00a0\u00bb de ce type. Il est toujours bon de leur rappeler que m\u00eame une IRM est un mod\u00e8le, avec ses limites et son cadre.<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<h2>R\u00e9sum\u00e9 en vid\u00e9o<\/h2>\n<p><a href=\"https:\/\/acamedia.ac-nice.fr\/edit_video.php?vid=6846\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">https:\/\/acamedia.ac-nice.fr\/edit_video.php?vid=6846<\/a><\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<h2>Lien<\/h2>\n<p><a href=\"http:\/\/acces.ens-lyon.fr\/logiciels\/EduAnat2Online\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">Logiciel EduAnat2 en ligne&nbsp;<\/a><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>par Philippe Cosentino La question revient souvent : \u00ab\u00a0Pourquoi sur certaines IRM anatomiques, la substance blanche c\u00e9r\u00e9brale appara\u00eet plus sombre que le cortex, alors que sur d&rsquo;autres c&rsquo;est l&rsquo;inverse ?\u00a0\u00bb.<\/p><p><a class=\"more-link btn\" href=\"https:\/\/www.pedagogie.ac-nice.fr\/svt\/?p=3228\">Lire la suite<\/a><\/p>\n","protected":false},"author":74,"featured_media":3232,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"ngg_post_thumbnail":0,"footnotes":""},"categories":[133,18],"tags":[137,405,406,44,402,403,404],"class_list":["post-3228","post","type-post","status-publish","format-standard","has-post-thumbnail","hentry","category-activites-sappuyant-sur-le-numerique","category-devant-ecran","tag-eduanat2","tag-inversees","tag-inversion","tag-irm","tag-ponderations","tag-t1","tag-t2","nodate","item-wrap"],"rttpg_featured_image_url":{"full":["https:\/\/www.pedagogie.ac-nice.fr\/svt\/wp-content\/uploads\/sites\/5\/2021\/05\/Capture3-1.jpg",1919,779,false],"landscape":["https:\/\/www.pedagogie.ac-nice.fr\/svt\/wp-content\/uploads\/sites\/5\/2021\/05\/Capture3-1.jpg",1919,779,false],"portraits":["https:\/\/www.pedagogie.ac-nice.fr\/svt\/wp-content\/uploads\/sites\/5\/2021\/05\/Capture3-1.jpg",1919,779,false],"thumbnail":["https:\/\/www.pedagogie.ac-nice.fr\/svt\/wp-content\/uploads\/sites\/5\/2021\/05\/Capture3-1-150x150.jpg",150,150,true],"medium":["https:\/\/www.pedagogie.ac-nice.fr\/svt\/wp-content\/uploads\/sites\/5\/2021\/05\/Capture3-1-300x122.jpg",300,122,true],"large":["https:\/\/www.pedagogie.ac-nice.fr\/svt\/wp-content\/uploads\/sites\/5\/2021\/05\/Capture3-1-1024x416.jpg",436,177,true],"1536x1536":["https:\/\/www.pedagogie.ac-nice.fr\/svt\/wp-content\/uploads\/sites\/5\/2021\/05\/Capture3-1-1536x624.jpg",1536,624,true],"2048x2048":["https:\/\/www.pedagogie.ac-nice.fr\/svt\/wp-content\/uploads\/sites\/5\/2021\/05\/Capture3-1.jpg",1919,779,false],"graphene_slider":["https:\/\/www.pedagogie.ac-nice.fr\/svt\/wp-content\/uploads\/sites\/5\/2021\/05\/Capture3-1-182x400.jpg",182,400,true],"graphene_featured_image":["https:\/\/www.pedagogie.ac-nice.fr\/svt\/wp-content\/uploads\/sites\/5\/2021\/05\/Capture3-1-436x177.jpg",436,177,true],"post-thumbnail":["https:\/\/www.pedagogie.ac-nice.fr\/svt\/wp-content\/uploads\/sites\/5\/2021\/05\/Capture3-1-1903x200.jpg",1903,200,true],"advps-thumb-one":["https:\/\/www.pedagogie.ac-nice.fr\/svt\/wp-content\/uploads\/sites\/5\/2021\/05\/Capture3-1.jpg",542,220,false]},"rttpg_author":{"display_name":"Philippe 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