{"id":5378,"date":"2025-11-30T16:04:20","date_gmt":"2025-11-30T15:04:20","guid":{"rendered":"https:\/\/www.pedagogie.ac-nice.fr\/svt\/?p=5378"},"modified":"2025-11-30T16:04:20","modified_gmt":"2025-11-30T15:04:20","slug":"une-electrophorese-de-substitution-pour-etudier-la-drepanocytose","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.pedagogie.ac-nice.fr\/svt\/?p=5378","title":{"rendered":"Une \u00e9lectrophor\u00e8se de substitution pour \u00e9tudier la dr\u00e9panocytose"},"content":{"rendered":"<p style=\"text-align: right;\"><em>par Adeline Gigliano<br \/>\nadjointe technique principal de recherche et de formation<br \/>\nATRFP1<br \/>\n<\/em><\/p>\n<h2 data-start=\"0\" data-end=\"520\">Introduction<\/h2>\n<p data-start=\"0\" data-end=\"520\">Dans l\u2019enseignement de sp\u00e9cialit\u00e9 de premi\u00e8re, lorsqu&rsquo;on aborde la relation entre g\u00e9notype et ph\u00e9notype en prenant l&rsquo;exemple de la dr\u00e9panocytose, <strong>l\u2019\u00e9lectrophor\u00e8se des h\u00e9moglobines<\/strong> est un passage oblig\u00e9 d\u00e8s que l\u2019on veut d\u00e9passer le simple r\u00e9cit clinique pour entrer dans le lien g\u00e9notype-ph\u00e9notype.<!--more--><\/p>\n<p data-start=\"0\" data-end=\"520\">En pratique pourtant, il est rarement possible de manipuler de \u00ab vrais \u00bb s\u00e9rums d\u2019individus pour des raisons \u00e9videntes de s\u00e9curit\u00e9, de logistique et de r\u00e9glementation. D\u2019o\u00f9 le succ\u00e8s des \u00e9lectrophor\u00e8ses de substitution, qui permettent de simuler la s\u00e9paration de mol\u00e9cules gr\u00e2ce \u00e0 de simples colorants.<\/p>\n<p data-start=\"522\" data-end=\"1091\">Ces montages ont toutefois un d\u00e9faut r\u00e9current que les \u00e9l\u00e8ves rep\u00e8rent vite, m\u00eame sans le formuler en ces termes : le caract\u00e8re tr\u00e8s \u00ab artificiel \u00bb des r\u00e9sultats. <strong>Les m\u00e9langes de colorants de couleurs diff\u00e9rentes produisent des profils spectaculaires mais peu r\u00e9alistes par rapport \u00e0 une v\u00e9ritable \u00e9lectrophor\u00e8se d\u2019h\u00e9moglobines<\/strong>, o\u00f9 les bandes r\u00e9v\u00e9l\u00e9es pr\u00e9sentent toutes la m\u00eame teinte. On se retrouve alors avec un r\u00e9sultat qui certes aide \u00e0 faire passer l\u2019id\u00e9e g\u00e9n\u00e9rale de migration diff\u00e9rentielle, mais au prix d\u2019une repr\u00e9sentation trompeuse du r\u00e9sultat attendu.<\/p>\n<p data-start=\"1093\" data-end=\"1643\">Le protocole pr\u00e9sent\u00e9 dans cet article s\u2019inscrit dans cette logique de substitution, tout en cherchant \u00e0 en limiter les d\u00e9rives. <strong>Il propose d\u2019utiliser un m\u00e9lange de deux colorants rouges dont les mobilit\u00e9s \u00e9lectrophor\u00e9tiques diff\u00e8rent l\u00e9g\u00e8rement<\/strong>, afin de simuler les profils d\u2019\u00e9lectrophor\u00e8se d\u2019individus homozygotes HbA\/\/HbA ou HbS\/\/HbS et h\u00e9t\u00e9rozygotes HbA\/\/HbS. On conserve ainsi les avantages des colorants alimentaires ou de laboratoire en termes de s\u00e9curit\u00e9 et de co\u00fbt, tout en obtenant des bandes d\u2019une couleur unique, plus proches visuellement d\u2019un profil r\u00e9el.<\/p>\n<p data-start=\"1093\" data-end=\"1643\">&nbsp;<\/p>\n<h2 data-start=\"1093\" data-end=\"1643\">Protocole (fiche laboratoire)<\/h2>\n<h3 data-start=\"1093\" data-end=\"1643\">Pr\u00e9paration des colorants<\/h3>\n<p data-start=\"189\" data-end=\"328\">Nous utilisons deux colorants rouges ayant des mobilit\u00e9s \u00e9lectrophor\u00e9tiques diff\u00e9rentes : le rouge Ponceau et le colorant alimentaire E124.<\/p>\n<p data-start=\"189\" data-end=\"328\"><em>Clin d\u2019\u0153il aux pratiques de laboratoire : dans une v\u00e9ritable \u00e9lectrophor\u00e8se de prot\u00e9ines, le rouge Ponceau est justement utilis\u00e9 comme colorant de r\u00e9v\u00e9lation apr\u00e8s la migration, et non comme constituant de l\u2019\u00e9chantillon.<\/em><\/p>\n<p data-start=\"330\" data-end=\"591\">Le rouge Ponceau doit \u00eatre dilu\u00e9 (facteur de dilution 10) afin de ne pas \u00eatre trop intense par rapport au colorant alimentaire. Il est possible que nous devions effectuer quelques ajustements de dilution en fonction de la marque du colorant alimentaire utilis\u00e9.<\/p>\n<p data-start=\"593\" data-end=\"780\">Une fois les deux colorants correctement \u00e9quilibr\u00e9s, nous les utilisons purs pour les individus homozygotes, ou m\u00e9lang\u00e9s (50 % de chaque) pour simuler le s\u00e9rum d\u2019un individu h\u00e9t\u00e9rozygote.<\/p>\n<p data-start=\"565\" data-end=\"754\">&nbsp;<\/p>\n<h3 data-start=\"565\" data-end=\"754\">Pr\u00e9paration du gel<\/h3>\n<p data-start=\"565\" data-end=\"754\">Il s&rsquo;agit d&rsquo;un gel de g\u00e9lose (Agar-agar) pr\u00e9par\u00e9 \u00e0 1%. Il est inutile d&rsquo;utiliser une solution tampon.<\/p>\n<p data-start=\"565\" data-end=\"754\">Pour 100 mL :<\/p>\n<ul>\n<li data-start=\"565\" data-end=\"754\">peser 0.8g d&rsquo;agar-agar<\/li>\n<li data-start=\"565\" data-end=\"754\">m\u00e9langer dans 100 ml d&rsquo;eau distill\u00e9e<\/li>\n<li data-start=\"565\" data-end=\"754\">porter \u00e0 \u00e9bullition dans un b\u00e9cher<\/li>\n<li data-start=\"565\" data-end=\"754\">laisser refroidir jusqu&rsquo;\u00e0 ce qu&rsquo;il soit possible de saisir le b\u00e9cher \u00e0 main nu (environ 60\u00b0C)<\/li>\n<li data-start=\"565\" data-end=\"754\">verser le gel en respectant les quantit\u00e9s pr\u00e9conis\u00e9es par le constructeur de la cuve<\/li>\n<li data-start=\"565\" data-end=\"754\">placer le peigne dans le gel<\/li>\n<\/ul>\n<p data-start=\"565\" data-end=\"754\">&nbsp;<\/p>\n<h3 data-start=\"1093\" data-end=\"1643\">Pr\u00e9paration du tampon de migration<\/h3>\n<p data-start=\"827\" data-end=\"949\">Puisqu\u2019il ne s\u2019agit pas de prot\u00e9ines, nous n\u2019utilisons pas de v\u00e9ritable solution tampon, mais simplement une eau min\u00e9rale.<\/p>\n<p data-start=\"951\" data-end=\"1164\">La difficult\u00e9 r\u00e9side dans le fait que, si l\u2019eau est trop min\u00e9ralis\u00e9e, l\u2019alimentation de la cuve se met en s\u00e9curit\u00e9 (l\u2019intensit\u00e9 du courant \u00e9tant trop forte), et si elle l\u2019est trop peu, la migration ne se fait pas.<\/p>\n<p data-start=\"1166\" data-end=\"1387\">Apr\u00e8s avoir test\u00e9 plusieurs marques, nous avons obtenu des r\u00e9sultats satisfaisants avec de l\u2019eau gazeuse de marque St-Yorre. Il est \u00e9galement possible de produire soi-m\u00eame une eau sal\u00e9e \u00e0 partir d\u2019eau distill\u00e9e et de sel.<\/p>\n<p data-start=\"1389\" data-end=\"1580\">Pr\u00e9cisons que nous utilisons des cuves distribu\u00e9es par Sordalab, mais que nous avons \u00e9galement obtenu par le pass\u00e9 des r\u00e9sultats satisfaisants avec des cuves provenant d\u2019autres distributeurs.<\/p>\n<p data-start=\"1389\" data-end=\"1580\">&nbsp;<\/p>\n<h3 data-start=\"1389\" data-end=\"1580\">D\u00e9p\u00f4t des \u00ab\u00a0s\u00e9rums\u00a0\u00bb<\/h3>\n<p data-start=\"1389\" data-end=\"1580\">Nous conseillons de mettre \u00e0 disposition les s\u00e9rums aux \u00e9l\u00e8ves dans des tubes Eppendorf rassembl\u00e9s dans un portoir ad\u00e9quat.<\/p>\n<p data-start=\"1389\" data-end=\"1580\">Les \u00e9l\u00e8ves d\u00e9poseront le contenu de chaque tube dans un puits, en respectant la quantit\u00e9 pr\u00e9conis\u00e9e.<\/p>\n<p data-start=\"1389\" data-end=\"1580\"><strong>ATTENTION : le rouge Ponceau peut provoquer des l\u00e9sions oculaires graves\/s\u00e9v\u00e8res (irritation), ainsi que sur la peau. Le port des gants et des lunettes est obligatoire.<\/strong><\/p>\n<p data-start=\"1093\" data-end=\"1643\"><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" class=\"alignnone size-full wp-image-5385\" src=\"https:\/\/www.pedagogie.ac-nice.fr\/svt\/wp-content\/uploads\/sites\/5\/2025\/11\/pictos.jpg\" alt=\"\" width=\"300\" height=\"146\"><\/p>\n<p data-start=\"1093\" data-end=\"1643\">&nbsp;<\/p>\n<p data-start=\"1093\" data-end=\"1643\">&nbsp;<\/p>\n<h3 data-start=\"1093\" data-end=\"1643\">R\u00e9sultat obtenu<\/h3>\n<p data-start=\"1608\" data-end=\"1711\">Apr\u00e8s 10 minutes de migration, les bandes sont suffisamment espac\u00e9es pour que le gel soit exploitable.<\/p>\n<div id=\"attachment_5379\" style=\"width: 854px\" class=\"wp-caption alignnone\"><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" aria-describedby=\"caption-attachment-5379\" class=\"size-full wp-image-5379\" src=\"https:\/\/www.pedagogie.ac-nice.fr\/svt\/wp-content\/uploads\/sites\/5\/2025\/11\/electro1.jpg\" alt=\"Gel obtenu\" width=\"854\" height=\"836\" srcset=\"https:\/\/www.pedagogie.ac-nice.fr\/svt\/wp-content\/uploads\/sites\/5\/2025\/11\/electro1.jpg 854w, https:\/\/www.pedagogie.ac-nice.fr\/svt\/wp-content\/uploads\/sites\/5\/2025\/11\/electro1-300x294.jpg 300w, https:\/\/www.pedagogie.ac-nice.fr\/svt\/wp-content\/uploads\/sites\/5\/2025\/11\/electro1-768x752.jpg 768w, https:\/\/www.pedagogie.ac-nice.fr\/svt\/wp-content\/uploads\/sites\/5\/2025\/11\/electro1-436x427.jpg 436w\" sizes=\"auto, (max-width: 854px) 100vw, 854px\" \/><p id=\"caption-attachment-5379\" class=\"wp-caption-text\">Gel obtenu avec les produits de substitution (colorant alimentaire et rouge Ponceau)<\/p><\/div>\n<p data-start=\"1713\" data-end=\"1837\">Comme on peut le voir sur la photographie, elles sont nettement s\u00e9par\u00e9es et la lecture du gel ne souffre d\u2019aucune ambigu\u00eft\u00e9.<\/p>\n<p data-start=\"1839\" data-end=\"1996\" data-is-last-node=\"\" data-is-only-node=\"\">Nous constatons certes une tr\u00e8s l\u00e9g\u00e8re nuance dans les teintes des deux rouges, mais elle reste si discr\u00e8te que, jusqu\u2019\u00e0 pr\u00e9sent, aucun \u00e9l\u00e8ve ne l\u2019a relev\u00e9e.<\/p>\n<p data-start=\"1093\" data-end=\"1643\">A titre de comparaison, voici \u00e0 quoi ressemble un gel lorsque l&rsquo;on utilise de v\u00e9ritables solutions d&rsquo;h\u00e9moglobines, et qu&rsquo;on les r\u00e9v\u00e8le avec &#8230; du rouge Ponceau.<\/p>\n<div id=\"attachment_5382\" style=\"width: 855px\" class=\"wp-caption alignnone\"><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" aria-describedby=\"caption-attachment-5382\" class=\"size-full wp-image-5382\" src=\"https:\/\/www.pedagogie.ac-nice.fr\/svt\/wp-content\/uploads\/sites\/5\/2025\/11\/Capture-decran-2025-11-29-172601.png\" alt=\"Gel obtenu avec d'authentiques solutions d'h\u00e9moglobine, r\u00e9v\u00e9l\u00e9es au rouge Ponceau.(source Sordalab)\" width=\"855\" height=\"301\" srcset=\"https:\/\/www.pedagogie.ac-nice.fr\/svt\/wp-content\/uploads\/sites\/5\/2025\/11\/Capture-decran-2025-11-29-172601.png 855w, https:\/\/www.pedagogie.ac-nice.fr\/svt\/wp-content\/uploads\/sites\/5\/2025\/11\/Capture-decran-2025-11-29-172601-300x106.png 300w, https:\/\/www.pedagogie.ac-nice.fr\/svt\/wp-content\/uploads\/sites\/5\/2025\/11\/Capture-decran-2025-11-29-172601-768x270.png 768w, https:\/\/www.pedagogie.ac-nice.fr\/svt\/wp-content\/uploads\/sites\/5\/2025\/11\/Capture-decran-2025-11-29-172601-436x153.png 436w\" sizes=\"auto, (max-width: 855px) 100vw, 855px\" \/><p id=\"caption-attachment-5382\" class=\"wp-caption-text\">Gel obtenu avec d&rsquo;authentiques solutions d&rsquo;h\u00e9moglobine, r\u00e9v\u00e9l\u00e9es au rouge Ponceau.<br \/>(source Sordalab)<\/p><\/div>\n<p data-start=\"1093\" data-end=\"1643\">&nbsp;<\/p>\n<h3 data-start=\"1093\" data-end=\"1643\">Conclusion<\/h3>\n<p data-start=\"16\" data-end=\"559\">Ce protocole d\u2019\u00e9lectrophor\u00e8se de substitution ne pr\u00e9tend \u00e9videmment pas reproduire fid\u00e8lement toutes les contraintes d\u2019une v\u00e9ritable \u00e9lectrophor\u00e8se d\u2019h\u00e9moglobines (et en cela pourrait ne pas \u00eatre adapt\u00e9 \u00e0 un usage dans le cadre des ECE).<\/p>\n<p data-start=\"16\" data-end=\"559\">Il s\u2019agit d\u2019un mod\u00e8le simplifi\u00e9, qui s\u2019affranchit des questions de s\u00e9curit\u00e9 biologique, de pr\u00e9paration des \u00e9chantillons et de r\u00e9glages fins des tampons. Mais il permet, avec un mat\u00e9riel courant et des produits peu co\u00fbteux, d\u2019obtenir des profils de migration suffisamment r\u00e9alistes pour travailler s\u00e9rieusement la notion de ph\u00e9notype mol\u00e9culaire dans le cadre de la dr\u00e9panocytose.<\/p>\n<p data-start=\"561\" data-end=\"1123\">L\u2019utilisation de deux colorants rouges aux mobilit\u00e9s diff\u00e9rentes pr\u00e9sente ici un avantage d\u00e9cisif par rapport aux protocoles plus classiques faisant appel \u00e0 des m\u00e9langes de couleurs vari\u00e9es : les bandes obtenues ressemblent davantage \u00e0 celles que l\u2019on observerait sur un gel r\u00e9el, avec une teinte homog\u00e8ne et des diff\u00e9rences qui portent sur la position, non sur la couleur. Les \u00e9l\u00e8ves sont ainsi amen\u00e9s \u00e0 se concentrer sur l\u2019essentiel, c\u2019est-\u00e0-dire la comparaison des profils HbA\/\/HbA, HbA\/\/HbS et HbS\/\/HbS, et la mise en relation de ces profils avec les g\u00e9notypes correspondants (<strong>par exemple en utilisant en parall\u00e8le le logiciel Geniegen2, et en fournissant aux \u00e9l\u00e8ves des arbres g\u00e9n\u00e9alogiques<\/strong>).<\/p>\n<p data-start=\"561\" data-end=\"1123\">On rappellera toutefois qu\u2019<strong>en contexte r\u00e9el, la visualisation des bandes sur le gel ne se fait qu\u2019apr\u00e8s une \u00e9tape suppl\u00e9mentaire de coloration<\/strong>, au cours de laquelle un colorant est ajout\u00e9 puis \u00e9ventuellement d\u00e9color\u00e9 en fond de gel. Dans notre protocole, la couleur est pr\u00e9sente d\u00e8s le d\u00e9part, ce qui simplifie la mise en \u0153uvre mais introduit un nouvel \u00e9cart par rapport \u00e0 la pratique de laboratoire. Libre \u00e0 chaque enseignante et chaque enseignant de <strong>d\u00e9cider s\u2019il est pertinent de signaler explicitement cette diff\u00e9rence aux \u00e9l\u00e8ves<\/strong>, ou de la r\u00e9server \u00e0 un temps d\u2019\u00e9change ult\u00e9rieur, par exemple pour discuter des limites du mod\u00e8le utilis\u00e9 et des compromis inh\u00e9rents aux simulations.<\/p>\n<p data-start=\"1125\" data-end=\"1639\" data-is-last-node=\"\" data-is-only-node=\"\">Ce dispositif reste perfectible : chacune et chacun pourra ajuster la dilution des colorants, la dur\u00e9e de migration ou la nature de l\u2019eau utilis\u00e9e en fonction de son mat\u00e9riel et de ses contraintes. Mais dans l\u2019\u00e9tat, il offre un compromis simple et robuste entre r\u00e9alisme visuel, faisabilit\u00e9 en classe et exigence scientifique minimale. C\u2019est pr\u00e9cis\u00e9ment dans cet espace, celui d\u2019une <strong>simulation assum\u00e9e comme telle<\/strong> mais contr\u00f4l\u00e9e, que cette \u00e9lectrophor\u00e8se \u00ab rouge sur rouge \u00bb trouve tout son int\u00e9r\u00eat.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>par Adeline Gigliano adjointe technique principal de recherche et de formation ATRFP1 Introduction Dans l\u2019enseignement de sp\u00e9cialit\u00e9 de premi\u00e8re, lorsqu&rsquo;on aborde la relation entre g\u00e9notype et ph\u00e9notype en prenant l&rsquo;exemple de la dr\u00e9panocytose, l\u2019\u00e9lectrophor\u00e8se des h\u00e9moglobines est un passage oblig\u00e9 d\u00e8s que l\u2019on veut d\u00e9passer le simple r\u00e9cit clinique pour entrer dans le lien g\u00e9notype-ph\u00e9notype.<\/p><p><a class=\"more-link btn\" href=\"https:\/\/www.pedagogie.ac-nice.fr\/svt\/?p=5378\">Lire la 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