Exemple
La banque PDB possède un modèle de myoglobine humaine référencé sous le code 2MM1. À partir de l'alignement
proposé en téléchargement on peut faire la liaison de ce modèle avec la séquence humaine :
Taper ensuite le code 2MM1
Le modèle 3d s'affiche ensuite (attendre un peu pour le téléchargement du modèle depuis la PDB).
Remarque : On peut visualiser en bas à droite de l'image, la chaîne latérale de l'acide aminé survolé dans la séquence.
Exemple
La coloration de l'alignement pris en exemple en fonction du debré de conservation des acides aminés donne le résultat suivant :
La coloration correspondante sur le modèle 3d permet de localiser dans l'espace les zones
conservées ou variables au cours de l'évolution.