Comprendre l'effet de substances pharmacologiques sur le récepteur AchBP

Résultats

Remarque : Les résultats des mesures peuvent varier selon les chaînes sélectionnées pour réaliser les mesures.
Exemple de résultats obtenus.
Effet Modèle Couple d'acides aminés Distance (nm)
Antagoniste AchBP - cobratoxine Cys187 - Trp143 1,63
AchBP - conotoxine Cys190 - Trp147 1,87
AchBP - curare Cys188 - Trp145 1,71
AchBP - strychnine Cys188 - Trp145 1,34
Agoniste AchBP - épibatidine Cys190 - Trp147 1,17
AchBP - nicotine Cys187 - Trp143 1,22
AchBPmut - acétylcholine Cys188 - Trp145 1,18
Apo AchBP Cys190 - Trp147 1,58

Distance Cys-Trp des chaînes d'AchBP, en nm, en fonction de la substance utilisée
Agonistes - Forme libre - Antagonistes

Conclusion

L'effet (agoniste ou antagoniste) des différentes substances pharmacologiques sur le récepteur nicotinique dépend de la déformation du site de liaison qu'elles provoquent.
Ce changement de conformation de la partie extracellulaire est couplé à l'ouverture du pore (bloquée par les antagonistes, provoquée par les agonistes).

Discussion

D'autres modèles de complexes ont été obtenus avec d'autres substances pharmacologiques. Les résultats sont compilés dans cet article où est réalisée une mesure similaire entre les mêmes acides aminés (les atomes retenus sont par contre à l'extrémité des chaînes latérales et non pas les carbones α).
Dans l'ensemble les conslusions précédentes sont confirmées.
On peut constater que pour une ouverture autour de celle obtenue avec la strychnine, certaines substances sont agonistes et d'autres antagonistes. Cette distance correspond à la limite de déclenchement du mécanisme de couplage entre les parties du récepteur.