Utilisation du logiciel de traitement de séquences Jalview en SVT

Application à l'étude de la conservation des acides aminés


Jalview : affichage et coloration de séquences, calcul d'arbre, manipulation de structures 3d

En résumé...

Jalview est un logiciel de traitement de séquences issu de la recherche qui permet une étude originale des relations entre séquence et structure des protéines.
En particulier, grâce aux options de coloration d'alignements de séquences et de liaison avec des modèles moléculaires, Jalview offre la possibilité de visualiser les zones conservées ou variables de protéines.
Les possibilités de ce logiciel sont intéressantes pour notre enseignement entre autres dans le cadre de l'étude des mécanismes de l'évolution, ou de la diversité des anticorps.


Pour démarrer Jalview :

Sur la plupart des configurations Jalview ne nécessite pas d'installation préalable et peut être démarré en suivant le lien suivant :
Démarrer Jalview

Lien vers Jalview

Contenu de ce dossier

Mode d'emploi
Applications pédagogiques



Auteur du dossier : Paul Pillot - Lycée régional de Valbonne - Novembre 2009